Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf183Q8QZS5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rnf183Q8QZS5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf183Q8QZS5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf183Q8QZS5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf183Q8QZS5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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