Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Prpf39Q8K2Z2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms