Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm48Q8K2X2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm48Q8K2X2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms