Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc12Q8K2L8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc12Q8K2L8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms