Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms