Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms