Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SltmQ8CH25 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SltmQ8CH25 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 681.3 ms