Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tshz3Q8CGV9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tshz3Q8CGV9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tshz3Q8CGV9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms