Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9030612E09RikQ8CE20 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms