Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc17Q8CE13 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms