Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc9Q8CDN9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms