Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6030452D12RikQ8CD33 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms