Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn5Q8CBA2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slfn5Q8CBA2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms