Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Podxl2Q8CAE9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Podxl2Q8CAE9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Podxl2Q8CAE9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms