Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tsr2Q8C8T8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms