Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FarsaQ8C0C7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FarsaQ8C0C7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms