Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip1Q8C079 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip1Q8C079 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms