Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh12Q8BYK4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh12Q8BYK4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms