Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsper4Q8BVN3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms