Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms