Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PcgF3Q8BTQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.7 ms