Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN59

Larp6, La-related protein 6, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp6Q8BN59 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp6Q8BN59 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Larp6Q8BN59 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp6Q8BN59 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms