Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms