Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms