Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms