Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc155Q80VJ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms