Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnQ80U62 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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RubcnQ80U62 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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RubcnQ80U62 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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RubcnQ80U62 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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RubcnQ80U62 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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RubcnQ80U62 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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RubcnQ80U62 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnQ80U62 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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