Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
NischQ80TM9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
NischQ80TM9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
NischQ80TM9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
NischQ80TM9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
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