Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpf1Q7TND5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms