Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Shq1Q7TMX5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms