Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms