Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssh1Q76I79 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms