Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nme8Q715T0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms