Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nup188Q6ZQH8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms