Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd200r4Q6XJV4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd200r4Q6XJV4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms