Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a1Q6X893 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms