Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms