Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9c1Q6UJY2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms