Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms