Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd4Q6PDQ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd4Q6PDQ2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd4Q6PDQ2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd4Q6PDQ2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd4Q6PDQ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd4Q6PDQ2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms