Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zbtb39Q6PDK0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms