Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms