Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac4Q6NZM9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms