Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frem2Q6NVD0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frem2Q6NVD0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frem2Q6NVD0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frem2Q6NVD0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frem2Q6NVD0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms