Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg16l2Q6KAU8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms