Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CltbQ6IRU5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms