Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Best3Q6H1V1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best3Q6H1V1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
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