Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6GQU0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6GQU0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6GQU0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6GQU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6GQU0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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