Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TroQ6DIC6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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