Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Smarca2Q6DIC0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca2Q6DIC0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms